Il seguito della prima e seconda stagione, basata come in passato sulla serie di videogiochi Megaman Battle Network, serie molto attesa sul suolo nipponico ha avuto successo come la precedente confermendo che Megaman Battle Network ha un ottimo seguito. In Giappone dove è stata mandata in onda senza censure e con la sigla originale Futatsu no Mirai, è stata portata in America e trasmessa a partire da Novembre 2004 dalla Kid's WB con molte censure come la cancellazione completa di alcuni episodi e inoltre la serie in America è stata mandata in onda a salti e con episodi non in ordine, anche in questo caso la sigla è stata sostituita. La serie arrivata in Italia su Jetix è stata mandata in onda con la sigla americana ma almeno con gli episodi in ordine e con minori censure.